• Afhalen na 1 uur in een winkel met voorraad
  • Gratis thuislevering in België vanaf € 30
  • Ruim aanbod met 7 miljoen producten
  • Afhalen na 1 uur in een winkel met voorraad
  • Gratis thuislevering in België vanaf € 30
  • Ruim aanbod met 7 miljoen producten

Genomics in the Cloud

Using Docker, Gatk, and Wdl in Terra

Geraldine Van Der Auwera, Brian O'Connor
Paperback | Engels
€ 120,95
+ 241 punten
Levering 2 à 3 weken
Eenvoudig bestellen
Veilig betalen
Gratis thuislevering vanaf € 30 (via bpost)
Gratis levering in je Standaard Boekhandel

Omschrijving

Data in the genomics field is booming. In just a few years, organizations such as the National Institutes of Health (NIH) will host 50+ petabytesâ or over 50 million gigabytesâ of genomic data, and theyâ re turning to cloud infrastructure to make that data available to the research community. How do you adapt analysis tools and protocols to access and analyze that volume of data in the cloud?

With this practical book, researchers will learn how to work with genomics algorithms using open source tools including the Genome Analysis Toolkit (GATK), Docker, WDL, and Terra. Geraldine Van der Auwera, longtime custodian of the GATK user community, and Brian Oâ Connor of the UC Santa Cruz Genomics Institute, guide you through the process. Youâ ll learn by working with real data and genomics algorithms from the field.

This book covers:

  • Essential genomics and computing technology background
  • Basic cloud computing operations
  • Getting started with GATK, plus three major GATK Best Practices pipelines
  • Automating analysis with scripted workflows using WDL and Cromwell
  • Scaling up workflow execution in the cloud, including parallelization and cost optimization
  • Interactive analysis in the cloud using Jupyter notebooks
  • Secure collaboration and computational reproducibility using Terra

Specificaties

Betrokkenen

Auteur(s):
Uitgeverij:

Inhoud

Aantal bladzijden:
493
Taal:
Engels

Eigenschappen

Productcode (EAN):
9781491975190
Verschijningsdatum:
12/05/2020
Uitvoering:
Paperback
Bestandsformaat:
Trade paperback (VS)
Afmetingen:
178 mm x 233 mm
Gewicht:
780 g
Standaard Boekhandel

Alleen bij Standaard Boekhandel

+ 241 punten op je klantenkaart van Standaard Boekhandel
MUST-HAVES

Hier bloeit iets

Nu dubbele punten op onze selectie nieuwe titels
MUST-HAVES
Hier bloeit iets
AANGERADEN

Onze cadeautips

voor Moederdag
AANGERADEN
Onze cadeautips voor Moederdag
MOEDERDAG ACTIE

Alleen in onze winkels: kortingsbon van € 10 voor e-books

bij een Vivlio e-reader
MOEDERDAG ACTIE
Vivlio e-reader + € 10 aan e-books
Standaard Boekhandel

Beoordelingen

We publiceren alleen reviews die voldoen aan de voorwaarden voor reviews. Bekijk onze voorwaarden voor reviews.