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Un biomarqueur ou marqueur biologique est une substance mesurée et évaluée objectivement en tant qu'indicateur d'un processus biologique normal, d'un processus pathogène ou de réponses pharmacologiques à une intervention thérapeutique. Un marqueur diagnostique idéal devrait indiquer la présence d'un processus pathologique avant que des dommages cliniques importants ne se soient produits. Dans le domaine de la parodontologie, les critères cliniques traditionnels sont souvent insuffisants pour déterminer les sites de la maladie active, pour surveiller la réponse au traitement ou pour mesurer le degré de susceptibilité à la progression future de la maladie. Les biomarqueurs apportent des connaissances sur la pharmacologie clinique et fournissent une base pour la conception d'essais cliniques qui évaluent rapidement et définitivement la sécurité et l'efficacité. Les chercheurs en biotechnologie et en médecine étudient actuellement l'utilisation des fluides buccaux pour le diagnostic des maladies buccales et systémiques et pour le développement de médicaments. Le développement d'un large spectre de facteurs marqueurs sera un objectif primordial de la recherche parodontale.